<div dir="ltr">Hi Professor Li,<div><br></div><div>This is my current storage situation after removing some of the unnecessary files in the /bigdata directory:</div><div><br></div><div>1.0K    .ipynb_checkpoints<br>8.1G        software<br>19G   reference<br>89G  TSS_prj<br><span style="background-color:rgb(255,255,0)">168G     .conda</span><br><span style="background-color:rgb(255,255,0)">544G ST_Domain_prj</span><br>826G        total<br></div><div><br></div><div>Most of the usage comes from the ST_Domain project and the conda environment. The reason for the large /ST_Domain_prj is because I have run the GAM function with different k numbers. And the large /.conda is because for each benchmarking method I created an environment and eash environment can be ~20GB.</div></div><br><div class="gmail_quote gmail_quote_container"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Dec 17, 2025 at 11:54 AM Wei Vivian Li via LiLab <<a href="mailto:lilab@lists.ucr.edu">lilab@lists.ucr.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><span class="gmail_default" style="font-size:small">We have 10T in the bigdata, where ~3.5T have been used to store shared data, which leaves ~6.5T to host files of all accounts. Given the current size of our group, it would be safe to try to limit the file size in individual accounts to ~1T.</span><br clear="all"></div><div><span class="gmail_default" style="font-size:small">Of course, this is also project-dependent, and some projects just require more storage space. If you are unsure about which files can be removed, please talk to me.</span></div><div><br></div><div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><b>Please address these issues today or let me know if you need more time.</b> Thanks!</div><br></div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div style="margin:0px;padding:0px;border:0px;line-height:inherit;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;vertical-align:baseline;color:black"><br></div><div style="margin:0px;padding:0px;border:0px;font-size:12pt;line-height:inherit;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;vertical-align:baseline;color:black"><br></div><div style="margin:0px;padding:0px;border:0px;font-size:12pt;line-height:inherit;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;vertical-align:baseline;color:black"></div></div></div></div><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Dec 17, 2025 at 10:56 AM Wei Vivian Li <<a href="mailto:weivivian.li1@ucr.edu" target="_blank">weivivian.li1@ucr.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><span class="gmail_default" style="font-size:small">Dear All,</span></div><div><br></div><div>It appears that our shared bigdata directory on HPCC is approaching its storage limit, which is making access, read, and write operations extremely slow for everyone.<br><br>Please take the following steps immediately:<br><ul><li>Check your storage usage in your bigdata directory by running:</li></ul>du -sch .[!.]* * | sort -h<br><ul><li>Review large subdirectories and files to determine whether they are still needed.</li></ul><ul><li>Delete intermediate or temporary files that are no longer necessary.</li></ul><ul><li>If you wish to keep older files, move them to your personal device or another appropriate storage location.</li></ul><ul><li>Do not delete original/raw data or key results, even if the project has been completed.</li></ul><br>Thank you for taking care of this promptly. Please let me know if you encounter any difficulty with the storage management.</div><div><br></div><div><b>Once you are done, please reply to this email with your overall file sizes before and after cleaning.</b></div><br><div><div dir="ltr" class="gmail_signature"></div></div><div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Best,</div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Vivian</div><br></div></div>
</blockquote></div>
_______________________________________________<br>
LiLab mailing list<br>
<a href="mailto:LiLab@lists.ucr.edu" target="_blank">LiLab@lists.ucr.edu</a><br>
<a href="https://lists.ucr.edu/mailman/listinfo/lilab" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.ucr.edu/mailman/listinfo/lilab</a><br>
</blockquote></div><div><br clear="all"></div><div><br></div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><span style="white-space:pre-wrap;color:rgb(13,13,13)"><font face="arial, sans-serif">Shiwei Fu</font></span></div><font face="arial, sans-serif"><span style="white-space:pre-wrap;color:rgb(13,13,13)">PhD Student</span><br style="white-space:pre-wrap;border:0px solid rgb(227,227,227);color:rgb(13,13,13)"><span style="white-space:pre-wrap;color:rgb(13,13,13)">Department of Statistics</span><br style="white-space:pre-wrap;border:0px solid rgb(227,227,227);color:rgb(13,13,13)"><span style="white-space:pre-wrap;color:rgb(13,13,13)">University of California, Riverside</span></font><br></div></div>