<div dir="ltr">Hi everyone,<div><br></div><div>I will be presenting at the <b>OCT 9</b> group meeting. I will introduce three major types of methods that can detect domains based on spatial transcriptomics data, especially when there are multiple samples. </div><div><br></div><div>These are the methods and their references: </div><div><br></div><div>1) Seurat basic workflow with Harmoney integration</div><div>2) BASS<br>3) IRIS<br><br>ref1 (Seurat) <a href="https://satijalab.org/seurat/">https://satijalab.org/seurat/</a><br>ref2 (Harmoney) <a href="https://www.nature.com/articles/s41592-019-0619-0">https://www.nature.com/articles/s41592-019-0619-0</a><br>ref3 (BASS) <a href="https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-022-02734-7">https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-022-02734-7</a><br>ref4 (IRIS) <a href="https://www.nature.com/articles/s41592-024-02284-9">https://www.nature.com/articles/s41592-024-02284-9</a><br clear="all"><div><br></div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><span style="white-space:pre-wrap;color:rgb(13,13,13)"><font face="arial, sans-serif">Shiwei Fu</font></span></div><font face="arial, sans-serif"><span style="white-space:pre-wrap;color:rgb(13,13,13)">PhD Student</span><br style="white-space:pre-wrap;border:0px solid rgb(227,227,227);color:rgb(13,13,13)"><span style="white-space:pre-wrap;color:rgb(13,13,13)">Department of Statistics</span><br style="white-space:pre-wrap;border:0px solid rgb(227,227,227);color:rgb(13,13,13)"><span style="white-space:pre-wrap;color:rgb(13,13,13)">University of California, Riverside</span></font><br></div></div></div></div>