<html><head><meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=us-ascii"></head><body style="overflow-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;">Dear All,<div><br></div><div>Prof. <b>Dae-Jin Yun</b> from Konkuk University (Korea) will visit UCR and give a special seminar on cold-induced chromatin dynamics in Arabidopsis.</div><div><br></div><div>Title: <b>Cold stress induced dynamic chromatin accessibility in Arabidopsis </b></div><div><br></div><div>Time: <b>July 11th, 12-1PM</b></div><div>Location: <b>Genomic Auditorium</b></div><div><br></div><div>Synopsis:</div><div><div>Plants exposed to various environmental stresses, including cold temperatures,</div><div>undergo differential gene expression and activate stress response pathways by various</div><div>molecular mechanisms, including chromatin remodeling. Here, we used genome-wide</div><div>chromatin accessibility studies to investigate the dynamic changes in chromosomes in</div><div>Arabidopsis. We show the heterochromatin structure was lost in the nucleus upon cold</div><div>exposure. There was a gain in chromatin accessibility throughout the genome, and </div><div>this was associated with histone reorganization in response to cold stress. In addition,</div><div>we observed differential gene expression that did not correspond with a gain in</div><div>chromatin accessibility upon cold stress. The differential gene expression was</div><div>mediated by positional CBFs/DREB1 (C-repeat Binding Factors/Dehydration-</div><div>Responsive Element-Binding) transcription factor recruitment. Binding of CBFs on</div><div>H2A.X.5 promoter led to its upregulation upon cold exposure. In contrast, the binding of</div><div>CBFs to H2A.W.12 enhancer led to its downregulation. Therefore, in response to</div><div>increased chromatin accessibility under cold stress, transcription factor CBFs play a</div><div>critical role in regulating gene expression depending on its binding locations in the</div><div>Arabidopsis genome.</div></div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>Meng</div><div><br></div><div>
<meta charset="UTF-8"><div dir="auto" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; overflow-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;"><div dir="auto" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; overflow-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;"><div dir="auto" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; overflow-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;">-- <br>Meng Chen</div><div dir="auto" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; overflow-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;">Professor of Cell Biology<br>Department of Botany & Plant Sciences<br>University of California, Riverside <br>Website: http://www.plasticgenome.org/</div></div></div>
</div>
<br></body></html>